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软件简介

Ggraph 是一个基于 D3 构建的复杂混合图形的库,它扩展了节点和链接的概念。非常适合一组或者多组节点连接的展示。

示例代码:

初始化:

ggraph.init('container');
ggraph.draw(converted);

合并节点到组中:

// Merge selected
ggraph.merge(selection.all());

// Into single group
ggraph.merge(['Maria West', 'Sheldon Roy']);

// Into several groups
ggraph.merge([
  ['A', 'B'],
  ['C', 'D']
]);

切分和删除:

ggraph.split(['Maria West', 'Sheldon Roy']);
ggraph.remove(['Maria West', 'Hazel Santiago']);

在线演示:https://gransk.com/ggraph.html

构建:

git clone https://github.com/pcbje/ggraph && cd ggraph
npm install
node_modules/.bin/karma tests/cover.conf.js
node_modules/.bin/karma tests/watch.conf.js
node_modules/.bin/grunt min
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代码

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2018/09/27 20:05

Anaconda 环境下 R 包 ggraph_1.0.2 安装小记

由于微信不允许外部链接,你需要点击文章尾部左下角的 "阅读原文",才能访问文中链接。 记录一下今天在 Anaconda3 环境下 R==3.4.3 中安装 ggraph 的一些问题。 install.packages("ggraph") 发现 libudunits2.so was not found 错误: > install.packages("ggraph") ...... checking for gcc... x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc checking whether we are using the GNU C compiler... yes checking whether x86_64-conda_cos6-...

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发表了博客
2018/05/17 09:43

R画网络图

R 画网络图 目的:用R做生信分析,画基因样本的网络图,从中观察样本的致病性情况。 一、所用到的包 library(tidyr) library(ggplot2) library(reshape2) library(readr) library(network) library(dplyr) library(plyr) library(sna) library(GGally) library(ggnetwork) library(tidygraph)# tidy graph analysis #library(tidyverse)# tidy data analysis library(ggraph) library(stringr) library(networkD3) library(igr...

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发表于AI & 大数据专区
2020/04/06 17:37

R语言做网络图的又一个小例子

使用R语言包ggraph做网络图需要准备的最基本的数据是: 1、一个包括一列数据的数据框,每一行是各个节点的名称 2、一个包含两列数据的数据框,每一行代表节点节点之间的连线 比如一个有四个节点的网络,每个节点是A,B,C,D。两两节点互相连接。数据的样子: > nodes<-data.frame(node=c("A","B","C","D")) > edges<-data.frame(node1=c("A","A","A","B","B","C"), + node2=c("B","C","D","C","D","D")) > nod...

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发表于AI & 大数据专区
2020/05/24 20:00

R语言可视化STRING分析的蛋白互作网络(PPI)~报错解决

之前分享了这篇文章 R语言可视化STRING分析的蛋白互作网络(PPI) 有一些朋友留言说在重复 net<-graph_from_data_frame(d=links,vertices=nodes,directed = T) 遇到了报错 Error in graph_from_data_frame(d = links, vertices = nodes, directed = T) : Some vertex names in edge list are not listed in vertex data frame 在这里记录一下原因和解决办法 R语言包ggraph可视化网络需要准备两个文件 一个是节点文件 另一个是节...

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发表于AI & 大数据专区
2020/11/12 22:29

R语言做网络图的又一个小例子

使用R语言包ggraph做网络图需要准备的最基本的数据是: 1、一个包括一列数据的数据框,每一行是各个节点的名称 2、一个包含两列数据的数据框,每一行代表节点节点之间的连线 比如一个有四个节点的网络,每个节点是A,B,C,D。两两节点互相连接。数据的样子: > nodes<-data.frame(node=c("A","B","C","D")) > edges<-data.frame(node1=c("A","A","A","B","B","C"), + node2=c("B","C","D","C","D","D")) > nod...

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发表了博客
2020/08/25 14:45

在 RedHat 使用 gdc-client 下载 TCGA 数据

今天,只聊一下 RedHat/CentOS 下 gdc-client 安装的那些事。 gdc-client,官网地址:https://gdc.cancer.gov/access-data/gdc-data-transfer-tool,是由 GDC 官方提供的一个可以在命令行下批量下载 TCGA 数据的客户端工具。 在 gdc-client 官网可以看到 Mac、Windows 和 Ubuntu 的二进制版本下载,却唯独没看到 CentOS/RedHat 版本的!而且还给了我们一个提示说,如果你想要安装 RedHat Enterprise Release 6 版本的 gdc-clie...

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发表于程序人生专区
2020/11/02 14:40

倒计时抢(数据分析)

点击上方“逆锋起笔”,公众号回复 pdf 领取大佬们推荐的学习资料 当当自营图书 “400-240” 优惠码:AGAHPM 使用渠道:当当小程序或当当APP 使用时间:今天~11.3 使用方法: 步骤一,挑选心仪的图书至购物车点击结算 步骤二,点击优惠券/码处 步骤三,输入优惠码AGAHPM 省省省的快乐喷泉 小程序直达购书专题 推荐几本必买的绝不后悔! >> 推 荐 书 单 << ▊《深入浅出数据分析》 ( 美) 米尔顿( Milton,M.)著 李芳译 《深入...

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发表了博客
2020/07/28 06:30

【R语言】书籍|Text Mining with R

昨天有小粉丝私信我有没有适合学习文本挖掘的书籍推荐,于是想到可以推出【R 书籍】这个专辑,分享和R语言相关的书籍,主要内容包括R实战,R语言与统计分析,R语言与机器学习,R语言与数据科学等。今日分享书籍是《Text Mining with R》 阅读链接:https://www.tidytextmining.com/index.html 复制链接,使用浏览器打开即可在线阅读。 这本书是介绍使用tidytext包和r中的其他整理工具进行文本挖掘的。tidytext包提供的功能相对简...

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2020/06/11 09:00

疯抢当当图书618优惠码,花120买300(数据分析篇)

博文视点联合胡同学特别送出一批优惠码 “实付满150减30” 可以和满减活动叠加使用 简单给大家分析一下这次到底能赚多大便宜 花120买300的书 目前图书本身还在96折左右,所以综合起来就是3折左右 这可是超大的优惠力度,还不赶紧上车! 怎么BUY? 优惠码:MYEEEF或F6B86E 使用渠道:当当小程序或当当APP 步骤一,挑选心仪的图书至购物车点击结算 步骤二,点击优惠券/码处 步骤三,输入优惠码MYEEEF或F6B86E(注意要大写) 需要注...

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