circos Perl可视化图形软件包

GPL
Perl
Windows
2012-04-09
杨子江

Circos 是一个Perl语言开发的自由可视化软件,使用GPL协议分发,以绘制输出圈图(原型风格的图)为最大特色;最初主要用于基因组序列相关数据的可视化,目前已应用于多个领域,例如 影视作品中的人物关系分析,物流公司的订单来源和流向分析等,大多数关系型数据都可以尝试用 circos来可视化。


Circos 是由加拿大的一位生物信息科学家 Martin Krzywinski 所开发,他同时是一位专业摄影师,最初他主要从事Linux系统管理等工作。Circos 使用Perl语言开发,所以可以安装在任何支持Perl的操作系统上如linux, mac os, windows 等;Circos 主要使用Perl的GD库来绘图,可输出PNG位图或SVG矢量图;Circos采用文本配置文件的方式来指定输入输出文件以及图形样式和绘图规则等。

    Circos 英文的mail list 在 http://groups.google.com/group/circos-data-visualization同时中文社区也很活跃,参考 http://code.google.com/p/circos-chn ,此处有一部分Circos中文相关的资料,同时有社区成员修改的circos版本供下载使用,以方便安装和入门。


Circos 案例:

基因组数据的可视化



Linux内核发展的可视化



影视作品人物关系的可视化


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评论(1)

杨子江
杨子江
最新的 Circos教程中文版 发布于 https://github.com/node/circos-cn (尚未完成) #circos#

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回答
circos 安装失败?

Circos 安装时,不少人遇到一些 perl 相关的 以及 GD库相关的错误信息,导致不能快速尝试circos,笔者简单列举如下: 1 circos是一...

2012/04/24 15:26

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2016/07/14 10:33
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