[e::bwa_idx_load_from_disk] fail to locate the index files

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Unable to load database on disk

https://my.oschina.net/u/1055150/blog/1835311

由于磁盘空间满了以后,导致zookeeper异常退出,清理磁盘空间后,zk启动报错,信息如下: 解决办法:

2018/06/25 00:00

org.postgresql.util.PSQLException: ERROR: could not find left sibling of block 10244 in index "idx_xxxxx"?

https://www.oschina.net/question/4585734_2319628

org.postgresql.util.PSQLException: ERROR: could not find left sibling of block 10244 in index "idx_xxxxx" 查询报错?...

2020/11/02 00:00

【问题】Could not locate PropertySource and the fail fast property is set, failing

https://my.oschina.net/u/4385595/blog/4289945

这是我遇到的问题 Could not locate PropertySource and the fail fast property is set, failing springcloud的其他服务读取不了配置中心得配置文件出错,原因是配置中心的一个配置文件有s...

2020/05/25 00:00

【问题】Could not locate PropertySource and the fail fast property is set, failing

https://my.oschina.net/u/4267086/blog/4289942

这是我遇到的问题 Could not locate PropertySource and the fail fast property is set, failing springcloud的其他服务读取不了配置中心得配置文件出错,原因是配置中心的一个配置文件有s...

2020/05/25 00:00

JQuery{eq(idx)/get(idx)/$(selector)[idx]}三者关系与区别

https://my.oschina.net/u/3101157/blog/799823

eq()方法返回的是一个JQuery对象,也就是[object Object]; get()方法返回的是DOM对象,也就是[object HTMLLIElement]; $(selector)[idx]返回的是DOM对象,也就是[object HTMLLIElement]; 我们...

2016/12/04 00:00

BWA-MEM算法记录

https://my.oschina.net/u/3732258/blog/1579511

BWA-MEM算法整体流程如下: 1 读入 bwt、options、reads; 2 利用mem_chain生成chain; 3 利用memchainflt过滤掉部分chain; 4 利用mem_chain2aln生成比对结果元数据。 BWA采用seed-and-exte...

2017/11/24 00:00

bwa 软件用法简介

https://my.oschina.net/u/4580290/blog/4626597

Version: 0.7.17-r1188Contact: Heng Li <lh3@sanger.ac.uk>Usage: bwa [options]Command: index index sequences in the FASTA format mem BWA-MEM algorithm fastmap identify supe...

2020/04/29 00:00

ArrayList add(int index,E element)

https://my.oschina.net/u/4382439/blog/3712772

ArrayList add(int index,E element) add(E e)方法的代码 1 /** 2 * Appends the specified element to the end of this list. 3 * 4 * @param e element to be appended to this list 5 * ...

2018/12/15 00:00

BWA-Samtools-Bcftools SNP calling

https://my.oschina.net/u/4323227/blog/4048107

SNP鉴定的标准流程有三个步骤: 一、mapping 使用BWA MEM将每个样本的测序数据比对到组装的参考序列。建立索引和比对: $ bwa index ref.fa $ bwa mem –t 40 ref.fa read1.fq read2.fq >al...

2018/03/14 00:00

Docker安装踩坑:E_FAIL 0x80004005的解决

https://my.oschina.net/u/3866531/blog/2990249

参考 菜鸟教程--Windows Docker 安装 http://www.runoob.com/docker/windows-docker-install.html 官方文档-Install Docker Toolbox on Windows https://docs.docker.com/toolbox/toolboxins...

2018/12/19 00:00

Django App(五) load static files

https://my.oschina.net/u/4415557/blog/4217728

经过前面4篇的努力,已经基本完成了,polls站点的功能,但是所有界面都没有涉及样式,和JavaScript的导入.到目前为止了解到的Django是通过解析Url来完成对客户端的响应的,那么组成站点所必须的c...

2018/01/25 00:00

BWA SAM文件格式

https://my.oschina.net/u/3732258/blog/1583585

SAM是一种序列比对格式标准, 由sanger制定,是以TAB为分割符的文本格式。主要应用于测序序列mapping到基因组上的结果表示,当然也可以表示任意的多重比对结果。 SAM要处理好的问题: (1)非...

2017/12/01 00:00

Anaconda3 Python3.7 报错 import _ssl DLL load fail error

https://my.oschina.net/u/437042/blog/4274743

本文由stackoverflow相关问题整理而来,具体链接如下: https://stackoverflow.com/questions/54175042/python-3-7-anaconda-environment-import-ssl-dll-load-fail-error 安装 Anaconda3 Py...

2020/05/11 00:00

aiohttp-index-aiohttp.web middleware to serve index files (e.g. index.html) when static directori...

https://my.oschina.net/u/4017343/blog/4859833

aiohttp_index middleware toserve index files (e.g. index.html) when static directories are requested. Usage .. code:: python will now serve when is requested. Dependencies Pytho...

2020/12/22 00:00

对COM组件的调用返回了错误 HRESULT E_FAIL

https://my.oschina.net/u/3471785/blog/4269475

在修改以前的一个窗口时,发现设计器报错:对COM组件的调用返回了错误 HRESULT E_FAIL。 当时以为是之前操作设计器时误删了什么代码,恢复了几个版本服务器的窗口代码都不行,于是是有什么本...

2020/05/07 00:00

bwa计算wig文件

https://my.oschina.net/u/3722845/blog/3000843

bwa会输出mapping不上的reads例如: A00268:187:H5HVYDSXX:2:1101:22824:1532 77 0 0 * 0 0 TGGGCCTCGGCCAGCGGGTTGATCAGCACCTGCTCGTTGCGCAGGTCCATCTTGCGGTTGACCTTGGGCGGCCTTTTGGCGACGAAGACG...

2019/01/13 00:00

bwa_pe_tool-用bwa将PE-fastq读数映射到参考基因组-Jeremiah H. Savage

https://my.oschina.net/u/4017343/blog/4849202

2020/12/23 00:00

ubuntu 安装软件时出现 E: Unable to locate package vsftpd

https://my.oschina.net/u/2501273/blog/679280

刚才一个朋友问我ubuntu系统安装httpd的时候报这个错误 root@ubuntu :~# apt-get install httpd Reading package lists... Done Building dependency tree Reading state information... Do...

2016/05/22 00:00

关于ArrayList$add(int index, E object)方法

https://www.oschina.net/question/2243031_181335

ArrayList有一个构造方法是带容量参数的 此时,我构建一个 ArrayList对象 根据以上的构造函数,那么这时array=new Object[6],它的容量应该是6,,那么当我调用 ArrayList$add(int index, E o...

2014/11/05 00:00
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